人类HPV生殖器感染被确定为子宫颈肿瘤的主要致病原，其中人乳头瘤病毒16型（HPV-16）是引发妇女子宫肿瘤的最主要型别，在世界上可引起一半的子宫颈癌。因此，目前HPV疫苗也主要针对HPV-16感染。大约有20%～30%的HPV感染妇女同时感染了多种类型的HPV，多重HPV感染间的相互影响还不太明了，尤其当使用疫苗或药物成功预防了HPV-16感染时，与其它HPV感染的平衡会受到什么样的影响还不清楚。而且，如果HPV-16的预防接种预期效果就会受到影响。
为调查HPV-16对其它类型HPV感染及持续时间的影响。1989年4月～1999年11月间，该作者在美国俄勒岗州波特兰市1765例巴氏涂片试验正常、无已知子宫肿瘤史的妇女中，选择其中1124例进行了两次被动随访，其中89例已知有HPV感染史。对两次随访采集的标本用相同的PCR法检测。
结果：HPV感染在较年轻妇女中更常见；以前有HPV-16感染史者通常更易感染其它类型HPV特别是HPV-18，-39，-45，-59或-66型（总OR=1.9，95%，CI：0.7～4.7）。同时发现，有HPV-16感染史者不再感染HPV-33，-35，-40，-54，-58或-83。存在HPV-16先前感染时，HPV-18，-31，-51，-58和-83感染持续存在的危险性有所增加，但无统计学意义。HPV-16感染比其它HPV持续时间更长，感染其它类型HPV的妇女其HPV-16感染持续时间没有改变。
有HPV-16先前感染时，感染HPV-31，-33，-35，-52和-58的危险性略有下降（OR=0.3，95%，CI：0.0～2.4），而感染HPV-18，-39，-45，-59或-68的危险性则增加了8倍。将HPV分为与宫颈癌联系大和联系小的两组，结果在HPV-16存在时，感染两组HPV的危险性都增加了，但两组HPV感染持续时间没有变化。
还研究了年龄和性行为对先前感染HPV-16可增加其它HPV感染危险性的影响。结果年轻组比年老组更易发生HPV感染（20.3%vs5.5%）,有0～1个性伴侣的妇女比有2个以上性伴侣者HPV感染率要低。
HPV-16感染的清除对感染其它类型HPV的影响研究发现，先前感染HPV-16的61名妇女如，不论其第2份标本检测结果如何，其感染其它HPV的危险性没有变化（OR=1.0，95%，CI：0.3～3.1），即HPV-16感染的清除对感染其它HPV的危险性没有影响。
结论：HPV-16感染可使随后其它类型HPV感染的危险性增加。持续感染数据显示，HPV-16伴发其它HPV的感染一旦定位于宫颈，以后就不会相互影响。总之，HPV-16感染的预防或清除不会增加其它类型HPV感染的危险性，这也是目前预防接种中所关心的理论问题。HPV各类型感染似乎像性病一样倾向相互独立。